Ambientada en 1999, cuando el fin del mundo se acerca rápidamente, Tokio se ha convertido en la zona cero del Armagedón a medida que los humanos con superpoderes comienzan a reunirse y tomar partido. Kamui Shirou es un poderoso esper que se cree que tiene la clave que determinará el destino de la humanidad.
Después de estar fuera durante seis años, regresa a Tokio para cumplir el último deseo de su madre y proteger a quienes le importan. Una puerta hacia su destino se abre cuando se reúne con su amigo de la infancia Fuuma Monou y su hermana menor Kotori, pero ¿a dónde lo llevará el destino?
¡La batalla psÃquica más grande de la Tierra está a punto de comenzar!